De nombreuses industries, essentielles à la production énergétique et à l’économie de la vallée de la Garonne, ont besoin d’eau. En quantité, l’eau est principalement utilisée comme fluide de refroidissement, la centrale thermonucléaire de Golfech en prenant la plus grande part. Mais l’eau est également indispensable à de nombreux procédés industriels, pour le nettoyage de machines ou de locaux ou tout simplement comme composante des produits finis.
Les quantités d’eau prélevées par l’industrie sont importantes : dans le bassin de la Garonne, elles sont presque égales aux prélèvements de l’irrigation. Mais, contrairement aux agriculteurs, les industriels restituent au milieu naturel la plus grande partie de leurs prélèvements, que ce soit directement (rejets) ou indirectement (compensation).
L’impact industriel sur les milieux aquatiques n’est donc pas tant quantitatif que qualitatif. En effet, l’eau restituée est souvent dégradée ou réchauffée. Il faut aussi mentionner l’impact négatif sur les milieux des éclusées, variations rapides et importantes de débit provoquées essentiellement par les centrales hydroélectriques pour suivre au plus près la demande des consommateurs.